| 所長室 |
綜理本所所務 |
| 副所長室 |
襄理所務 |
| 車輛管理科 |
掌理車輛檢驗、發照登記及審核管理事項 |
| 駕駛人管理科 |
掌理汽車駕駛人執照與技工執照考驗、核發及駕訓班管理事項 |
| 運輸管理科 |
掌理公民營汽車運輸業督導管理事項 |
| 企劃及裁罰科 |
掌理研考及監理業務規劃事項，違反強制汽車責任保險、公路法、道路交通管理處罰事件及汽車運輸業管理規則之處理，監理規費與稅費及代辦業務管理等有關企劃及裁罰事項 |
| 交通安全科 |
掌理交通安全教育及宣導，優良駕駛人選拔審查，路邊臨檢督導，違反公路法與汽車運輸業管理規則及道路交通管理處罰條例之稽查，裝載整體物、危險物品及動力機械申請臨時通行證之核發等有關交通安全管理事項 |
| 監理資訊科 |
掌理公路監理資訊應用服務策略規劃、環境規劃及管理，資通安全規劃及推動等有關公路監理資訊事項 |
| 人事室 |
依法辦理人事管理事項 |
| 主計室 |
依法辦理歲計、會計及統計事項 |
| 政風室 |
依法辦理政風事項 |
| 秘書室 |
掌理公文研考、文書、印信、檔案管理、出納、事務管理、財產管理 |